Idi na sadržaj

MTERF

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
MTERF
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3MVA, 3MVB, 3N6S, 3N7Q, 5CO0, 5CRJ, 5CKY, 5CRK

Identifikatori
AliasiMTERF1
Vanjski ID-jeviOMIM: 602318 MGI: 3704243 HomoloGene: 5073 GeneCards: MTERF1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za MTERF
Genomska lokacija za MTERF
Bend7q21.2Početak91,692,008 bp[1]
Kraj91,880,702 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za MTERF
Genomska lokacija za MTERF
Bend5 A1|5Početak4,242,367 bp[2]
Kraj4,247,651 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
double-stranded DNA binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta mitochondrial matrix
mitochondrial nucleoid
mitohondrija
citosol
Biološki proces termination of mitochondrial transcription
mitochondrion organization
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
DNA geometric change
DNA-templated transcription, termination
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001301134
NM_001301135
NM_006980

NM_001042670

RefSeq (bjelančevina)

NP_001288063
NP_001288064
NP_008911

NP_001036135

Lokacija (UCSC)Chr 7: 91.69 – 91.88 MbChr 5: 4.24 – 4.25 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Mitohondrijskoterminacjski faktor transkripcije 1, znan i kao aMTERF1, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom MTERF.[5][6][7][8]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 399 aminokiselina, а molekulska težina 45.778 Da.[9]

1020304050
MQSLSLGQTSISKGLNYLTIMAPGNLWHMRNNFLFGSRCWMTRFSAENIF
KSVSFRLFGVKCHNTDSEPLKNEDLLKNLLTMGVDIDMARKRQPGVFHRM
ITNEQDLKMFLLSKGASKEVIASIISRYPRAITRTPENLSKRWDLWRKIV
TSDLEIVNILERSPESFFRSNNNLNLENNIKFLYSVGLTRKCLCRLLTNA
PRTFSNSLDLNKQMVEFLQAAGLSLGHNDPADFVRKIIFKNPFILIQSTK
RVKANIEFLRSTFNLNSEELLVLICGPGAEILDLSNDYARRSYANIKEKL
FSLGCTEEEVQKFVLSYPDVIFLAEKKFNDKIDCLMEENISISQIIENPR
VLDSSISTLKSRIKELVNAGCNLSTLNITLLSWSKKRYEAKLKKLSRFA

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira transkripciju terminacijskog faktora u mitohondrijama. Protein učestvuje u slabljenju transkripcije iz mitohondrijskog genoma; ovo slabljenje omogućava veće nivoe ekspresije 16S ribosomske RNK u odnosu na nizvodni gen za tRNK. Proizvod ovog gena ima tri motiva leucinskog zatvarača koji su u pregradama povezani s dva osnovna domena koji su oba potrebna za vezivanje DNK. Postoje dokazi da za ovaj protein zatvarači sudjeluju u intramolekulnim interakcijama koje uspostavljaju trodimenzijsku strukturu potrebnu za vezanje DNK.[5]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000127989 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053178 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: MTERF mitochondrial transcription termination factor".
  6. ^ Daga A, Micol V, Hess D, Aebersold R, Attardi G (april 1993). "Molecular characterization of the transcription termination factor from human mitochondria". J. Biol. Chem. 268 (11): 8123–30. doi:10.1016/S0021-9258(18)53070-2. PMID 7681833. Arhivirano s originala, 17. 4. 2020. Pristupljeno 27. 9. 2021.
  7. ^ Asin-Cayuela J, Helm M, Attardi G (april 2004). "A monomer-to-trimer transition of the human mitochondrial transcription termination factor (mTERF) is associated with a loss of in vitro activity". J. Biol. Chem. 279 (15): 15670–7. doi:10.1074/jbc.M312537200. PMID 14744862.
  8. ^ Asin-Cayuela J, Schwend T, Farge G, Gustafsson CM (juli 2005). "The human mitochondrial transcription termination factor (mTERF) is fully active in vitro in the non-phosphorylated form". J. Biol. Chem. 280 (27): 25499–505. doi:10.1074/jbc.M501145200. PMID 15899902.
  9. ^ "UniProt, Q99551" (jezik: engleski). Pristupljeno 27. 9. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]